De acordo com uma fonte interna da Eidos Montreal, uma sequela para Deus Ex: Mankind Divided já está em desenvolvimento há mais de 1 ano.
A fonte, que deseja manter-se anónima, revelou que as microtransações de Deus Ex: Mankind Divided foram algo que a Square Enix de certa maneira obrigou a Eidos a introduzir no jogo, tendo acabado estas por ser implementadas no final do desenvolvimento.
Quanto à sequência, a fonte diz que a equipa de desenvolvimento da Eidos Montreal foi dividida em duas, e estavam a trabalhar em dois projetos em simultâneo, conhecidos como DXNG e DXNG 2 (Deus Ex Next Gen). O primeiro acabou por se tornar em Mankind Divided, enquanto que o segundo está em desenvolvimento desde 2015, não tendo ainda sido revelado.
Alguns atrasos aconteceram também, pois a Square Enix colocou os desenvolvedores do projeto DXNG2 a trabalhar em Deus Ex: Mankind Divided para conseguir entregar o jogo dentro do prazo.